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保种分析

通过G矩阵亲缘关系分析展示群体中任意两个体间的基因组亲缘关系,帮助客户进行群体保种分析。

分析流程

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    图一

    通过G矩阵亲缘关系分析展示群体中任意两个体间的基因组亲缘关系,

    方格填充颜色越接近红色表示该值越大,即两个个体亲缘关系越近,

    亲缘关系较近的个体会聚类到一起,

    且他们所在的单元格颜色更接近红色;

    对角线上是每个样本与其本身的亲缘关系值,所以呈现红色。

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    图二

    聚类分析是从一组复杂数据产生一个相当简单的类结构。

    通过聚类分析把关系密切的个体聚合到一个小的分类单元,直到把所有样本都聚合完毕,关系相对疏远的个体聚合到一个较大的分类单元。

    基因组上的长纯合片段(Runs of homozygosity, ROH)在所有群体中广泛存在。

    长的ROH可指示发生在较近期的亲缘关系。这样的片段越多,个体内存在近交的可能性越高。